在上海，涉及到电子GMP无尘厂房改造的公司有很多，但是具体哪一家公司最合适，需要根据你的具体需求和预算来决定。以下是一些在上海可能提供此类服务的公司：

1. 上海某某净化工程有限公司：专业从事无尘、无菌净化工程的设计、施工及维护，拥有丰富的电子GMP无尘厂房改造经验。
2. 上海某某建筑装饰工程有限公司：除了建筑装饰工程外，也提供无尘厂房的改造和建设服务，包括电子GMP无尘厂房。
3. 上海某某机电设备安装工程有限公司：专注于机电设备安装工程，包括无尘厂房的改造和建设，可以提供从设计到施工的全方位服务。

以上公司只是其中的一部分，可以通过搜索引擎或者相关行业目录来查找更多的公司。在选择公司时，建议你考虑公司的资质、经验、口碑、价格等多个因素，选择最符合你需求的公司。同时，也可以要求公司提供过往项目的案例和客户反馈，以便更好地了解其服务质量和水平。

注意，以上信息仅供参考，具体选择还需根据您的实际需求和预算来决定。